Родился 13 января 1936 года в селе Довольное ныне Доволенского района Новосибирской области в крестьянской семье.
В 1950 году, отучившись четыре класса школы, был вынужден начать трудовую деятельность в колхозе им. Хрущева.
Сначала на быках возил грузы в МТС, а потом трудолюбивого настырного паренька послали на курсы комбайнеров. С тех пор он не расставался с техникой целых полвека.
С 1956 по 1958 год – служба в рядах Советской Армии.
С 1958 по 1996 год проработал в совхозе «Центральный» Доволенского района.
Шофер, тракторист, комбайнер, затем Василию Петровичу доверили тракторно-полеводческую бригаду, которую он возглавлял десять лет. Бригаде № 1 присвоили звание коллектива высокой культуры земледелия.
За достижение выдающихся успехов в повышении производительности труда, большой личный клад в увеличение производства зерна и проявленный трудовой героизм Указом Президиума Верховного Совета СССР от 22 марта 1985 года комбайнеру совхоза «Центральный» Доволенского района Василию Петровичу Кондратенко присвоено звание Героя Социалистического Труда.
В 1986 году был избран делегатом XXVII съезда КПСС.
В Доволенском районе был учрежден приз имени Героя Социалистического Труда В.П. Кондратенко, который по итогам соревнования вручался лучшим механизаторам. Земляки подсчитали: за двадцать лет герой-хлебороб намолотил 160 тысяч центнеров зерна – это 335 вагонов, или шесть составов, грузовых поездов. И нет в Доволенском районе человека, который бы повторил это достижение.
За трудовой героизм награжден тремя орденами Ленина, многими медалями и знаками трудового отличия.
С 1996 года на пенсии, продолжал трудиться до 1999 года.
В настоящее время Василий Петрович проживает в поселке Красный Яр Новосибирского района [242, 247, 413, 430, 447].